1、锈斑是山东黄锈石使用中经常会遇到的现象。预防锈斑的关键是在山东黄锈石加工后再进行的表面处理，以防止含铁矿物氧化后渗出表面，一般使用油性防护剂。处理锈斑主要是除锈剂，但由于除锈剂多属于酸性，所以对不耐酸的山东黄锈石如大理石、白云石质，使用前应进行试验，必要时加水稀。

2、水斑、湿痕。预防水斑主要是注入树脂使山东黄锈石防水，以阻隔空气中的水份与山东黄锈石或水泥内部物质接触，降其化学反应条件。处理水斑主要是采用渗透染色剂来改变原山东黄锈石的颜色。

3、白华现象。预防白华现象主要是在山东黄锈石加工后用渗透型防护剂对山东黄锈石进行六面防护处理。处理白华现象主要是用清水冲洗已清洗过的山东黄锈石表面，使其中性为止，阴干后再对山东黄锈石表面及接缝进行养护处理。